MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Micromonospora aurantiaca ATCC 27029 chromosome

Total Repeats: 198355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014391	CGAC	2	8	324	331	25 %	0 %	25 %	50 %	302864509
2	NC_014391	ACC	2	6	353	358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864509
3	NC_014391	CGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
4	NC_014391	ATC	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864509
5	NC_014391	GCA	2	6	388	393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
6	NC_014391	TCG	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864509
7	NC_014391	GCT	2	6	445	450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864509
8	NC_014391	GCC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
9	NC_014391	CGGC	2	8	532	539	0 %	0 %	50 %	50 %	302864509
10	NC_014391	CGA	2	6	571	576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
11	NC_014391	GCCC	2	8	584	591	0 %	0 %	25 %	75 %	302864509
12	NC_014391	ACG	2	6	636	641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
13	NC_014391	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
14	NC_014391	CGC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
15	NC_014391	AGC	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
16	NC_014391	CGA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
17	NC_014391	GCGCC	2	10	764	773	0 %	0 %	40 %	60 %	302864509
18	NC_014391	CCG	2	6	780	785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
19	NC_014391	CGG	3	9	787	795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
20	NC_014391	CCGC	2	8	796	803	0 %	0 %	25 %	75 %	302864509
21	NC_014391	CCGG	3	12	812	823	0 %	0 %	50 %	50 %	302864509
22	NC_014391	GCGCC	2	10	883	892	0 %	0 %	40 %	60 %	302864509
23	NC_014391	CGA	2	6	895	900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
24	NC_014391	GCC	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
25	NC_014391	CGG	2	6	934	939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
26	NC_014391	CCGC	2	8	965	972	0 %	0 %	25 %	75 %	302864509
27	NC_014391	CG	3	6	999	1004	0 %	0 %	50 %	50 %	302864509
28	NC_014391	CCGG	2	8	1026	1033	0 %	0 %	50 %	50 %	302864509
29	NC_014391	ACC	3	9	1044	1052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864509
30	NC_014391	GCG	3	9	1059	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
31	NC_014391	CGG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
32	NC_014391	GCG	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
33	NC_014391	CGC	2	6	1177	1182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
34	NC_014391	CTG	2	6	1265	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864509
35	NC_014391	ACG	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
36	NC_014391	CG	3	6	1306	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	302864509
37	NC_014391	GAG	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864509
38	NC_014391	ACGA	2	8	1343	1350	50 %	0 %	25 %	25 %	302864509
39	NC_014391	TCA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864509
40	NC_014391	CGA	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
41	NC_014391	TCC	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864509
42	NC_014391	CGA	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
43	NC_014391	AGG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864509
44	NC_014391	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302864509
45	NC_014391	CAA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302864509
46	NC_014391	AGC	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
47	NC_014391	GGA	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864509
48	NC_014391	GCC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
49	NC_014391	AGA	2	6	1644	1649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864509
50	NC_014391	GGC	2	6	1651	1656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
51	NC_014391	CCG	2	6	1676	1681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864509
52	NC_014391	GAG	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864509
53	NC_014391	TGC	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864509
54	NC_014391	ACT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864509
55	NC_014391	GGA	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864509
56	NC_014391	CTCCCG	2	12	1918	1929	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	302864509
57	NC_014391	CG	3	6	1942	1947	0 %	0 %	50 %	50 %	302864509
58	NC_014391	GACC	2	8	1978	1985	25 %	0 %	25 %	50 %	302864509
59	NC_014391	CGG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
60	NC_014391	ACG	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
61	NC_014391	CAG	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864509
62	NC_014391	GCG	2	6	2077	2082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864509
63	NC_014391	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302864510
64	NC_014391	CCAG	2	8	3347	3354	25 %	0 %	25 %	50 %	302864510
65	NC_014391	GCC	2	6	3388	3393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
66	NC_014391	GCC	2	6	3404	3409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
67	NC_014391	CGC	2	6	3456	3461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
68	NC_014391	CCA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864510
69	NC_014391	GGA	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864510
70	NC_014391	CGC	3	9	3576	3584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
71	NC_014391	CCG	2	6	3593	3598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
72	NC_014391	CGC	2	6	3615	3620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
73	NC_014391	CGA	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864510
74	NC_014391	GAT	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302864510
75	NC_014391	GCA	2	6	3674	3679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864510
76	NC_014391	CGAC	2	8	3695	3702	25 %	0 %	25 %	50 %	302864510
77	NC_014391	GAC	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864510
78	NC_014391	TCC	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864510
79	NC_014391	GGC	2	6	3850	3855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864510
80	NC_014391	ACC	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864510
81	NC_014391	GCC	2	6	3905	3910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
82	NC_014391	CCG	2	6	3931	3936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864510
83	NC_014391	CGTCGC	2	12	3978	3989	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302864510
84	NC_014391	GGT	2	6	4002	4007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864510
85	NC_014391	CAC	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864510
86	NC_014391	TGC	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864510
87	NC_014391	GGCG	2	8	4083	4090	0 %	0 %	75 %	25 %	302864510
88	NC_014391	GAG	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864510
89	NC_014391	GCG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864510
90	NC_014391	GC	3	6	4199	4204	0 %	0 %	50 %	50 %	302864510
91	NC_014391	TCG	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864510
92	NC_014391	GGTACC	2	12	4286	4297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	302864510
93	NC_014391	GGC	2	6	4400	4405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864511
94	NC_014391	GC	3	6	4423	4428	0 %	0 %	50 %	50 %	302864511
95	NC_014391	GGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864511
96	NC_014391	CGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864511
97	NC_014391	CG	3	6	4520	4525	0 %	0 %	50 %	50 %	302864511
98	NC_014391	CCG	2	6	4542	4547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864511
99	NC_014391	CCA	2	6	4560	4565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864511
100	NC_014391	CGA	2	6	4567	4572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864511
101	NC_014391	CAT	3	9	4600	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864511
102	NC_014391	CGG	2	6	4612	4617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864511
103	NC_014391	CGA	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864511
104	NC_014391	CG	3	6	4644	4649	0 %	0 %	50 %	50 %	302864511
105	NC_014391	CGG	2	6	4699	4704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864511
106	NC_014391	CGG	2	6	4741	4746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864511
107	NC_014391	GCT	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864511
108	NC_014391	GGC	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864511
109	NC_014391	CGT	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864511
110	NC_014391	GCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864511
111	NC_014391	CTG	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864511
112	NC_014391	CGA	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864511
113	NC_014391	TCA	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864511
114	NC_014391	GAC	2	6	5165	5170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864511
115	NC_014391	CGC	2	6	5191	5196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864511
116	NC_014391	CAG	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864511
117	NC_014391	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864511
118	NC_014391	CCG	2	6	5264	5269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864512
119	NC_014391	GCGTCG	2	12	5302	5313	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302864512
120	NC_014391	TCG	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
121	NC_014391	GCC	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864512
122	NC_014391	CGG	2	6	5455	5460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864512
123	NC_014391	GGT	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864512
124	NC_014391	GCT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
125	NC_014391	CGC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864512
126	NC_014391	GC	3	6	5584	5589	0 %	0 %	50 %	50 %	302864512
127	NC_014391	GGA	2	6	5612	5617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864512
128	NC_014391	CGC	3	9	5649	5657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864512
129	NC_014391	GAC	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864512
130	NC_014391	CTG	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
131	NC_014391	GCAAC	2	10	5732	5741	40 %	0 %	20 %	40 %	302864512
132	NC_014391	GCT	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
133	NC_014391	CGT	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
134	NC_014391	CTCG	2	8	5763	5770	0 %	25 %	25 %	50 %	302864512
135	NC_014391	CGG	2	6	5777	5782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864512
136	NC_014391	CGG	2	6	5789	5794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864512
137	NC_014391	GCA	2	6	5834	5839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864512
138	NC_014391	GCCG	2	8	5856	5863	0 %	0 %	50 %	50 %	302864512
139	NC_014391	TGG	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864512
140	NC_014391	ACG	2	6	5908	5913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864512
141	NC_014391	GGC	2	6	5918	5923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864512
142	NC_014391	GCG	2	6	5934	5939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864512
143	NC_014391	CG	3	6	5988	5993	0 %	0 %	50 %	50 %	302864512
144	NC_014391	CGC	3	9	6011	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864512
145	NC_014391	CGC	2	6	6035	6040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864512
146	NC_014391	CAC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864512
147	NC_014391	TCG	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
148	NC_014391	CGA	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864512
149	NC_014391	CTG	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864512
150	NC_014391	GGTGCT	2	12	6209	6220	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	302864512
151	NC_014391	CGA	2	6	6221	6226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864512
152	NC_014391	CCGG	2	8	6247	6254	0 %	0 %	50 %	50 %	302864512
153	NC_014391	CGG	2	6	6278	6283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864512
154	NC_014391	GAC	3	9	6315	6323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864512
155	NC_014391	CCCG	2	8	6402	6409	0 %	0 %	25 %	75 %	302864513
156	NC_014391	CG	3	6	6408	6413	0 %	0 %	50 %	50 %	302864513
157	NC_014391	GACGC	2	10	6425	6434	20 %	0 %	40 %	40 %	302864513
158	NC_014391	GCCG	2	8	6465	6472	0 %	0 %	50 %	50 %	302864513
159	NC_014391	GGCCG	2	10	6492	6501	0 %	0 %	60 %	40 %	302864513
160	NC_014391	GCGG	2	8	6510	6517	0 %	0 %	75 %	25 %	302864513
161	NC_014391	CGG	2	6	6538	6543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864513
162	NC_014391	GGC	3	9	6546	6554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864513
163	NC_014391	CGGCG	2	10	6562	6571	0 %	0 %	60 %	40 %	302864513
164	NC_014391	CGGCGA	2	12	6579	6590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302864513
165	NC_014391	CG	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	302864513
166	NC_014391	TGA	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302864513
167	NC_014391	GC	3	6	6676	6681	0 %	0 %	50 %	50 %	302864513
168	NC_014391	GCA	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864513
169	NC_014391	GCCG	2	8	6693	6700	0 %	0 %	50 %	50 %	302864513
170	NC_014391	GGT	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302864513
171	NC_014391	GCA	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864513
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173	NC_014391	GGA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864513
174	NC_014391	CTG	2	6	6835	6840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864513
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180	NC_014391	CGC	2	6	7000	7005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864514
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234	NC_014391	TCGACT	2	12	9411	9422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	302864517
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240	NC_014391	GTCG	2	8	9643	9650	0 %	25 %	50 %	25 %	302864517
241	NC_014391	CAA	2	6	9703	9708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302864517
242	NC_014391	GGC	2	6	9725	9730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864517
243	NC_014391	GAG	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302864517
244	NC_014391	CGT	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
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246	NC_014391	GCT	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
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248	NC_014391	ATC	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864517
249	NC_014391	AGACCA	2	12	9894	9905	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	302864517
250	NC_014391	TCG	2	6	9960	9965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
251	NC_014391	ATC	3	9	9998	10006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302864517
252	NC_014391	GGC	2	6	10021	10026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864517
253	NC_014391	CGC	2	6	10039	10044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864517
254	NC_014391	CAG	2	6	10046	10051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864517
255	NC_014391	GC	3	6	10052	10057	0 %	0 %	50 %	50 %	302864517
256	NC_014391	GCT	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
257	NC_014391	CG	3	6	10134	10139	0 %	0 %	50 %	50 %	302864517
258	NC_014391	TCG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
259	NC_014391	CGGC	2	8	10170	10177	0 %	0 %	50 %	50 %	302864517
260	NC_014391	GAA	2	6	10276	10281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864517
261	NC_014391	ACG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864517
262	NC_014391	GCCGAC	2	12	10376	10387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	302864517
263	NC_014391	GCT	3	9	10411	10419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
264	NC_014391	GCT	2	6	10423	10428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864517
265	NC_014391	GCC	2	6	10475	10480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864517
266	NC_014391	CCG	2	6	10481	10486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864517
267	NC_014391	AAG	2	6	10508	10513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864517
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269	NC_014391	AAG	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302864517
270	NC_014391	CGCC	2	8	10591	10598	0 %	0 %	25 %	75 %	302864517
271	NC_014391	GAC	2	6	10601	10606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864517
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279	NC_014391	CGT	2	6	11207	11212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864518
280	NC_014391	ACG	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302864518
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282	NC_014391	CGT	2	6	11426	11431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302864518
283	NC_014391	CGC	2	6	11438	11443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302864518
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287	NC_014391	GCTGCG	2	12	11540	11551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	302864518
288	NC_014391	ACC	2	6	11587	11592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302864518
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291	NC_014391	GC	3	6	11749	11754	0 %	0 %	50 %	50 %	302864518
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295	NC_014391	TTC	2	6	11814	11819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302864518
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301	NC_014391	TCC	2	6	12034	12039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302864518
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382	NC_014391	GGC	2	6	14802	14807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302864519
383	NC_014391	CG	3	6	14823	14828	0 %	0 %	50 %	50 %	302864519
384	NC_014391	GGGCC	2	10	14834	14843	0 %	0 %	60 %	40 %	302864519
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